MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinomonas sp. MWYL1 chromosome

Total Repeats: 88791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009654	TGC	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994044
2	NC_009654	ATT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152994044
3	NC_009654	GAT	2	6	469	474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994044
4	NC_009654	CCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994044
5	NC_009654	AAT	2	6	583	588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994044
6	NC_009654	GA	3	6	597	602	50 %	0 %	50 %	0 %	152994044
7	NC_009654	GAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994044
8	NC_009654	GTG	2	6	707	712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
9	NC_009654	GGT	2	6	778	783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
10	NC_009654	AAT	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994044
11	NC_009654	TGC	2	6	861	866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994044
12	NC_009654	CT	3	6	908	913	0 %	50 %	0 %	50 %	152994044
13	NC_009654	TA	3	6	915	920	50 %	50 %	0 %	0 %	152994044
14	NC_009654	TGG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
15	NC_009654	ATG	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994044
16	NC_009654	GGT	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
17	NC_009654	TTG	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994044
18	NC_009654	TTA	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152994044
19	NC_009654	TGA	2	6	1110	1115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994044
20	NC_009654	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	152994044
21	NC_009654	AAG	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994044
22	NC_009654	T	6	6	1156	1161	0 %	100 %	0 %	0 %	152994044
23	NC_009654	GGT	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
24	NC_009654	CAG	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994044
25	NC_009654	TTGG	2	8	1265	1272	0 %	50 %	50 %	0 %	152994044
26	NC_009654	CCG	2	6	1294	1299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994044
27	NC_009654	ACGT	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	152994044
28	NC_009654	ATA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994044
29	NC_009654	TAC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994044
30	NC_009654	TGT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994044
31	NC_009654	ACCA	2	8	1660	1667	50 %	0 %	0 %	50 %	152994044
32	NC_009654	TGG	2	6	1695	1700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994044
33	NC_009654	ACAA	2	8	1781	1788	75 %	0 %	0 %	25 %	152994044
34	NC_009654	ACC	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994044
35	NC_009654	AAT	2	6	1841	1846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994045
36	NC_009654	GTC	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994045
37	NC_009654	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994045
38	NC_009654	CAAA	2	8	1913	1920	75 %	0 %	0 %	25 %	152994045
39	NC_009654	TGG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994045
40	NC_009654	TTGG	2	8	2001	2008	0 %	50 %	50 %	0 %	152994045
41	NC_009654	GAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994045
42	NC_009654	GCGT	2	8	2242	2249	0 %	25 %	50 %	25 %	152994045
43	NC_009654	GATC	2	8	2255	2262	25 %	25 %	25 %	25 %	152994045
44	NC_009654	TAC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994045
45	NC_009654	GTT	2	6	2478	2483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994045
46	NC_009654	ATC	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994045
47	NC_009654	A	6	6	2599	2604	100 %	0 %	0 %	0 %	152994045
48	NC_009654	GTG	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994045
49	NC_009654	AAG	3	9	2737	2745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994045
50	NC_009654	GAA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994045
51	NC_009654	AAG	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994045
52	NC_009654	CAG	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994045
53	NC_009654	GAA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994045
54	NC_009654	GCA	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994045
55	NC_009654	TGT	2	6	2918	2923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994045
56	NC_009654	TC	3	6	3066	3071	0 %	50 %	0 %	50 %	152994046
57	NC_009654	TTG	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994046
58	NC_009654	CACAAG	2	12	3206	3217	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152994046
59	NC_009654	TCA	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994046
60	NC_009654	ATT	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152994046
61	NC_009654	TTCA	2	8	3485	3492	25 %	50 %	0 %	25 %	152994046
62	NC_009654	GGC	2	6	3571	3576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152994046
63	NC_009654	TCAA	2	8	3612	3619	50 %	25 %	0 %	25 %	152994046
64	NC_009654	CA	3	6	3791	3796	50 %	0 %	0 %	50 %	152994046
65	NC_009654	CAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994046
66	NC_009654	TTG	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994046
67	NC_009654	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994046
68	NC_009654	CAGA	2	8	3982	3989	50 %	0 %	25 %	25 %	152994046
69	NC_009654	GTT	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994046
70	NC_009654	TTA	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152994046
71	NC_009654	ACA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994046
72	NC_009654	AAAT	2	8	4159	4166	75 %	25 %	0 %	0 %	152994047
73	NC_009654	CGTA	2	8	4207	4214	25 %	25 %	25 %	25 %	152994047
74	NC_009654	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994047
75	NC_009654	GAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
76	NC_009654	TGG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994047
77	NC_009654	GGT	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994047
78	NC_009654	AAC	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994047
79	NC_009654	TTGT	2	8	4691	4698	0 %	75 %	25 %	0 %	152994047
80	NC_009654	AGA	2	6	4786	4791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
81	NC_009654	TTC	2	6	4793	4798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994047
82	NC_009654	TGG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994047
83	NC_009654	TTG	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994047
84	NC_009654	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994047
85	NC_009654	AGA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
86	NC_009654	AAT	2	6	4970	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994047
87	NC_009654	CGG	2	6	4990	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152994047
88	NC_009654	GTG	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994047
89	NC_009654	AAG	2	6	5055	5060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
90	NC_009654	GAA	2	6	5068	5073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
91	NC_009654	CAA	2	6	5085	5090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994047
92	NC_009654	CGA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994047
93	NC_009654	TTCTC	2	10	5153	5162	0 %	60 %	0 %	40 %	152994047
94	NC_009654	TCT	2	6	5183	5188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994047
95	NC_009654	CAG	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994047
96	NC_009654	ATC	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994047
97	NC_009654	TGAT	2	8	5283	5290	25 %	50 %	25 %	0 %	152994047
98	NC_009654	CGT	2	6	5315	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
99	NC_009654	TCG	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
100	NC_009654	TCG	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
101	NC_009654	TGGA	2	8	5661	5668	25 %	25 %	50 %	0 %	152994047
102	NC_009654	CTT	3	9	5695	5703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994047
103	NC_009654	ATC	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994047
104	NC_009654	ACC	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994047
105	NC_009654	CATG	2	8	5854	5861	25 %	25 %	25 %	25 %	152994047
106	NC_009654	GT	3	6	5955	5960	0 %	50 %	50 %	0 %	152994047
107	NC_009654	AGC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994047
108	NC_009654	ATCT	2	8	6134	6141	25 %	50 %	0 %	25 %	152994047
109	NC_009654	GTC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
110	NC_009654	CAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994047
111	NC_009654	TTC	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994047
112	NC_009654	GAA	2	6	6266	6271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
113	NC_009654	GTG	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994047
114	NC_009654	CGT	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
115	NC_009654	TGA	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994047
116	NC_009654	AAG	2	6	6342	6347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994047
117	NC_009654	AAC	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994047
118	NC_009654	ACC	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994047
119	NC_009654	CGT	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
120	NC_009654	TGA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994047
121	NC_009654	CAC	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994047
122	NC_009654	CGT	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994047
123	NC_009654	GCT	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994048
124	NC_009654	GGC	2	6	6699	6704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152994048
125	NC_009654	GCA	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994048
126	NC_009654	GCCA	2	8	6919	6926	25 %	0 %	25 %	50 %	152994048
127	NC_009654	CGGCCG	2	12	6966	6977	0 %	0 %	50 %	50 %	152994048
128	NC_009654	CAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994048
129	NC_009654	TGC	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994048
130	NC_009654	CAAC	2	8	7028	7035	50 %	0 %	0 %	50 %	152994048
131	NC_009654	CGC	2	6	7231	7236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994048
132	NC_009654	TGCTG	2	10	7248	7257	0 %	40 %	40 %	20 %	152994048
133	NC_009654	TAA	2	6	7291	7296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994048
134	NC_009654	TTGCA	2	10	7312	7321	20 %	40 %	20 %	20 %	152994048
135	NC_009654	CAA	2	6	7323	7328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994048
136	NC_009654	AAT	2	6	7417	7422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994048
137	NC_009654	TTGC	2	8	7424	7431	0 %	50 %	25 %	25 %	152994048
138	NC_009654	T	6	6	7437	7442	0 %	100 %	0 %	0 %	152994048
139	NC_009654	GAC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994048
140	NC_009654	ATA	2	6	7502	7507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994048
141	NC_009654	AAT	2	6	7593	7598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994049
142	NC_009654	G	6	6	7702	7707	0 %	0 %	100 %	0 %	152994049
143	NC_009654	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994049
144	NC_009654	CGT	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994049
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146	NC_009654	CTT	2	6	7843	7848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994049
147	NC_009654	GATTG	2	10	7929	7938	20 %	40 %	40 %	0 %	152994049
148	NC_009654	TTTG	2	8	8107	8114	0 %	75 %	25 %	0 %	152994050
149	NC_009654	TG	3	6	8123	8128	0 %	50 %	50 %	0 %	152994050
150	NC_009654	CCG	2	6	8157	8162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994050
151	NC_009654	AGC	2	6	8179	8184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994050
152	NC_009654	GTTTCT	2	12	8208	8219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152994050
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154	NC_009654	ATT	2	6	8321	8326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152994050
155	NC_009654	AGCA	2	8	8357	8364	50 %	0 %	25 %	25 %	152994050
156	NC_009654	CCA	2	6	8388	8393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994050
157	NC_009654	A	6	6	8502	8507	100 %	0 %	0 %	0 %	152994050
158	NC_009654	ATC	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994050
159	NC_009654	AGAT	2	8	8598	8605	50 %	25 %	25 %	0 %	152994050
160	NC_009654	TGCT	2	8	8702	8709	0 %	50 %	25 %	25 %	152994050
161	NC_009654	GTTG	2	8	8729	8736	0 %	50 %	50 %	0 %	152994050
162	NC_009654	T	6	6	8744	8749	0 %	100 %	0 %	0 %	152994050
163	NC_009654	CAGCA	2	10	8774	8783	40 %	0 %	20 %	40 %	152994050
164	NC_009654	CAG	2	6	8925	8930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994051
165	NC_009654	TCG	2	6	8937	8942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994051
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167	NC_009654	TCA	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994051
168	NC_009654	ACGGT	2	10	9064	9073	20 %	20 %	40 %	20 %	152994051
169	NC_009654	TGC	2	6	9083	9088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994051
170	NC_009654	CTTC	2	8	9147	9154	0 %	50 %	0 %	50 %	152994051
171	NC_009654	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994051
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173	NC_009654	T	6	6	9440	9445	0 %	100 %	0 %	0 %	152994051
174	NC_009654	GCT	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994051
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177	NC_009654	TA	3	6	9826	9831	50 %	50 %	0 %	0 %	152994051
178	NC_009654	TCA	2	6	9978	9983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994051
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187	NC_009654	CAAT	2	8	10314	10321	50 %	25 %	0 %	25 %	152994051
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200	NC_009654	GA	3	6	10946	10951	50 %	0 %	50 %	0 %	152994051
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213	NC_009654	TTG	2	6	12423	12428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152994053
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232	NC_009654	CCTG	2	8	13598	13605	0 %	25 %	25 %	50 %	152994054
233	NC_009654	AG	3	6	13616	13621	50 %	0 %	50 %	0 %	152994054
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240	NC_009654	GCCT	2	8	13876	13883	0 %	25 %	25 %	50 %	152994054
241	NC_009654	TGC	2	6	13908	13913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994054
242	NC_009654	TAA	2	6	13987	13992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994054
243	NC_009654	ATG	2	6	13994	13999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994054
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245	NC_009654	T	6	6	14185	14190	0 %	100 %	0 %	0 %	152994055
246	NC_009654	TGA	2	6	14221	14226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994055
247	NC_009654	CTTTT	2	10	14229	14238	0 %	80 %	0 %	20 %	152994055
248	NC_009654	CCAA	2	8	14259	14266	50 %	0 %	0 %	50 %	152994055
249	NC_009654	T	6	6	14312	14317	0 %	100 %	0 %	0 %	152994055
250	NC_009654	GTC	2	6	14393	14398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994055
251	NC_009654	AC	3	6	14419	14424	50 %	0 %	0 %	50 %	152994055
252	NC_009654	GATCGA	2	12	14431	14442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152994055
253	NC_009654	T	6	6	14522	14527	0 %	100 %	0 %	0 %	152994055
254	NC_009654	AAT	2	6	14616	14621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994056
255	NC_009654	CAA	2	6	14624	14629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994056
256	NC_009654	CAA	2	6	14651	14656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152994056
257	NC_009654	GCA	2	6	14751	14756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994056
258	NC_009654	TAC	2	6	14813	14818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994056
259	NC_009654	GAA	2	6	14840	14845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994056
260	NC_009654	GCC	2	6	14885	14890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994056
261	NC_009654	TC	3	6	14935	14940	0 %	50 %	0 %	50 %	152994056
262	NC_009654	CCA	2	6	14988	14993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994056
263	NC_009654	CCG	2	6	15009	15014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994056
264	NC_009654	AAG	2	6	15036	15041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994056
265	NC_009654	GATA	2	8	15098	15105	50 %	25 %	25 %	0 %	152994056
266	NC_009654	AAT	2	6	15235	15240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994056
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268	NC_009654	ATC	2	6	15318	15323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994056
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272	NC_009654	ACC	2	6	15569	15574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994056
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286	NC_009654	ATG	2	6	16214	16219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994057
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299	NC_009654	GAT	2	6	16741	16746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994057
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389	NC_009654	AAG	2	6	21467	21472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152994061
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